El Ministerio de Salud tiene a su cargo la determinación y conducción de la política de salud del Gobierno, de acuerdo con el Decreto de Gabinete No. 1 del 15 de enero de 1969 y el Estatuto Orgánico de Salud. La regulación, la conducción y el desempeño de las funciones esenciales de salud pública son responsabilidades exclusivas del Ministerio de Salud, en tanto que la armonización de la provisión de los servicios de salud, el financiamiento y la vigilancia del aseguramiento son responsabilidades que comparte con la Caja de Seguro Social (CSS) y el Ministerio de Economía y Finanzas.

Comparte también algunas funciones de conducción con otras instituciones:

el Instituto Conmemorativo Gorgas de Estudios de la Salud; el Consejo Técnico de Salud, que es responsable de otorgar la autorización para el libre ejercicio de la profesión médica, y la Autoridad Nacional del Ambiente, encargada de la regulación ambiental. (AU)