La fibrosis quística (FQ) es una enfermedad genética autosómica recesiva, que afecta a 1 de cada 2500 recién nacidos de poblaciones caucásicas y predispone a los pacientes a una colonizaron/infección de las vías aéreas inferiores. Esta ultima, es la causa más importante de morbilidad y mortalidad que se asocia a los pacientes con fibrosis quistica. Desarrollamos un método de diagnostico rápido basado en multiplex-PCR (m-PCR) de los agentes etiológicos de relevancia en los pacientes con FQ. La aplicación de la m-PCR resulto un método rápido, reproducible y especifico para las especies estudiadas. Analizamos 83 muestras de esputos procedentes de Argentina, y Brasil remitidos de diferentes centros de atención al paciente fibroquístico aplicando los métodos convencionales de cultivo y el diagnostico molecular, ambos en paralelo. En nuestro país el agente etiológico mas prevalente, utilizando el método molecular resultó ser P.aeruginosa (60 porciento ), luego, el complejo Burkholderia cepacia (BCC) (30 porciento ) y Staphylococcus aureus meticilino resistente (17 porciento ) y a la actualidad no se ha detectado Mycobacterium tuberculosis, ni Nontuberculous Mycobacterium. La aplicación del método molecular permitió la identificación de una nueva especie no identificada del complejo Burkholderia cenocepacia prevalente en la infecciones pulmonares de estos pacientes en nuestro país y realizar un seguimiento de la cronoinfección en pacientes infectados con P.aeruginosa que presentaban diferentes perfiles de susceptibilidad antibiótica. El diagnostico molecular, basado en RAPD-PCR permitió estudiar la dispersión clonal de los aislamientos de P.aeruginosa en un mismo paciente que presentaba diferentes morfotipos (mucoide y no mucoide). La implementación del diagnóstico rápido basado en la m-PCR contribuirá a mejorar el diagnostico de las infecciones pulmonares en los pacientes, detectar y prevenir las primoinfecciones logrando así disminuir los días de internación y los costos de salud. Además, permitirá conocer y detectar prevalencia de diferentes cepas epidémicas circulantes y aportar a las medidas de control, tratamiento y mejorar la calida de vida del paciente fibroquístico H