El padecimiento de enfermedades orgánicas crónicas por parte de los niños lleva al surgimiento de factores psicológicos que tienen consecuencias en la adherencia al tratamiento y en la salud integral del niño y la familia. La percepción de los niños de su relación con sus padres está relacionada con la capacidad de adaptación que pueden desarrollar. Asimismo, frente a una misma conducta infantil, los padres la interpretan de manera diferencial de acuerdo a su nivel de tolerancia interna. Esta tolerancia resulta ser predictora de la presencia de problemas comportamentales y emocionales en niños. El objetivo de este estudio fue comparar esas variables en niños con y sin cuadros orgánicos crónicos. Se realizó un estudio observacional analítico transversal en niños de 6 y 7 años de edad con enfermedades orgánicas crónicas (enfermedad celíaca, enfermedad renal crónica y asma) que se atienden en el Hosp. "Prof. Dr. J.P. Garrahan", incluyendo un grupo de comparación de niños sin trastornos. La muestra quedó constituida por 94 díadas de madres y niños, 49 de población clínica y 45 de población normal. Se emplearon escalas estandarizadas administradas en entrevistas individuales a padres y niños. Los resultados indican menor tolerancia en las madres de población clínica (t= 3,794, p<.000), un mayor grado de problemas comportamentales y emocionales (t= 4,176; p<.000) y una percepción infantil de un mayor grado de control hostil en población clínica que en población normal (t=2,387; p=.019). Estos resultados permitirán desarrollar intervenciones tempranas en las interacciones padres e hijos que sufren trastornos orgánicos crónicos.