INTRODUCCIÓN La provincia de Misiones presenta una alta tasa de mortalidad por cáncer de cuello de útero (CCU). Además, la prevalencia de infección por virus del papiloma humano (VPH) descripta en las mujeres de la ciudad de Posadas y en las de las comunidades indígenas Mbya-Guaraní de la selva misionera son marcadamente diferentes (30% y 50%, respectivamente). Sin embargo, la existencia de posibles factores de riesgo genéticos, asociados al origen étnico de las poblaciones, no ha sido completamente explorada. OBJETIVOS Analizar el rol de la variación genética del ADN mitocondrial (ADNmt) en el desarrollo de lesiones de cuello de útero y CCU en una muestra de mujeres de Posadas. MÉTODOS Los linajes de ADNmt (amerindio, europeo y africano) fueron determinados mediante PCR/secuenciación del ADNmt en muestras de ADN genómico de mujeres de Posadas (81 casos y 75 controles). RESULTADOS La contribución del ADNmt al acervo genético de la ciudad fue amerindio en un 67,2%, europeo en un 26,7% y africano en un 6,1% (modelo tri-híbrido de poblaciones mixtas). Al estratificar estos resultados por grupos, se encontraron diferencias significativas en la distribución de los linajes. En particular, las lesiones de cuello de útero fueron 4 veces más frecuentes en mujeres que presentaban ADNmt no amerindio, comparadas con aquellas portadoras de mitocondrias amerindias (OR 4,4; IC95% 1,9-9,9). DISCUSIÓN El presente trabajo constituye el primer registro de un estudio de asociación entre marcadores genéticos del ADNmt y la susceptibilidad a lesiones de cuello de útero y/o riesgo de CCU en una población de alto riesgo de Argentina. Sin embargo, una importante limitación de los resultados es la existencia de posibles subestructuras poblacionales que podrían generar asociaciones espurias. El efecto de confusión de la estratificación poblacional y el linaje de ADNmt deberá ser evaluado en futuros estudios.