El surgimiento del COVID-19 y su expansión pandémica ha repercutido profundamente en todos los aspectos que hacen a la reproducción social, generando insondables consecuencias. La presente investigación tuvo como objetivo indagar y analizar el impacto social, sanitario y económico de la pandemia COVID-19 en comunidades indígenas de la provincia de Catamarca, buscando identificar también las diferentes estrategias construidas por parte de estas comunidades para hacer frente a este fenómeno. Asimismo, se propuso registrar las percepciones presentes en las comunidades indígenas con relación al COVID-19 y a las medidas implementadas a raíz del contexto de pandemia. Como caso de estudio se trabajó con seis comunidades diaguitas del departamento Santa María (Catamarca), las cuales integran la Unión de los Pueblos de la Nación Diaguita (UPND). La investigación ha tenido un carácter exploratorio y un diseño metodológico predominantemente cualitativo, basado en la realización de entrevistas en profundidad como principal instrumento de recolección de datos y de un relevamiento en las diferentes comunidades involucradas mediante la implementación de entrevistas estructuradas. Los resultados brindan información acerca de los impactos sanitarios, económicos, socioculturales y territoriales de la pandemia COVID-19 y las medidas implementadas en comunidades diaguitas. Se destaca la importancia de la existencia de prácticas y saberes vinculados a la “medicina tradicional” en las comunidades, así como los procesos de organización (inter)comunitaria para hacer frente a las situaciones adversas. Asimismo, se evidencia la existencia de ciertas tensiones entre las comunidades indígenas (con sus cosmovisiones y sus prácticas ancestrales) y el sistema de salud oficial, y la importancia que adquieren políticas públicas de salud que permitan la articulación y complementación de saberes de los distintos paradigmas en tensión, el de la medicina tradicional y la biomedicina.