INTRODUCCIÓN Las anomalías congénitas (AC) presentan una prevalencia al nacimiento de un 3% a 5%. Las AC son la segunda causa de mortalidad infantil, representando más del 25%. Existen factores, de muy difícil registro, que juegan como variables de estas patologías, que hacen incierto el conocer las causas y evoluciones de estos cuadros. En general, en el origen de estas enfermedades hay una interacción entre condiciones genéticas y factores ambientales y/o sociodemográficos. Hay dos maneras de analizar estos patologías, prevalencias y mortalidad. OBJETIVOS Describir la distribución de prevalencias y mortalidad por AC en Argentina, explorando la relación de las éstas con factores ambientales y sociodemográficos. MÉTODOS. Tres bases de datos de AC fueron utilizadas, dos de prevalencias y una de mortalidad; se calcularon tasas medias expresadas por nacimientos evaluados, para las prevalencias; y por tasa de mortalidad infantil por AC. Se analizaron las representatividades de cada uno de los registros. Se construyeron tres variables ambientales (superficies sembradas totales, hectáreas sembradas por habitante y porcentaje de población expuesta a arsénico elevado en aguas); y, tres variables sociodemográficas (condiciones de vida, educación y cobertura desalud). Se utilizaron métodos de correlaciones (buscando asociaciones) y probabilidades de riesgos (OR). RESULTADOS Las tasas de prevalencia y mortalidad mostraron provincias por encima de las nacionales. Las representatividades de prevalencias se presentan bajas. Asociaciones y aumentos de riesgos significativos, en relación a variables ambientales y sociodemográficas, particularmente con mortalidad. DISCUSION En Argentina, las bases de datos de prevalencia tienen una baja representatividad, no así las de mortalidad; lo que permite mostrar asociaciones contradictorias en las primeras, y muy significativas en las segundas.