INTRODUCCIÓN La infección por el virus de la hepatitis B (VHB) es un problema de salud pública mundial. El virus de la hepatitis D (HDV) requiere la función auxiliar de HBV para su ensamblaje y transmisión. Argentina muestra una baja prevalencia de infecciones por VHB y VHD, pero esto puede variar según la región geográfica y el grupo vulnerable buscado. OBJETIVO Estudiar la epidemiología molecular del HBV y HDV en una población hospitalaria del conurbano bonaerense y observar marcadores de infección eventualmente asociados. METODOLOGÍA Se realizó un estudio molecular de 152 muestras de plasma con marcadores de infección por HBV. Para ello, se extrajo ADN y se amplificó la región parcial del S/P y preC/C de HBV por PCR y n-PCR, respectivamente. Para estudiar HDV en el total de muestras, se extrajo ARN y se amplificó la región parcial Delta por n-PCR además se realizó serológica para HDV por Elisa (anti-HDV; Abott). Las muestras positivas se secuenciaron y los árboles filogenéticos de distancia (N-J) se construyeron con el programa MEGA. Para analizar otros marcadores de infección asociados se utilizaron ELISAs para HCV y HIV (Abbott). RESULTADOS Del total muestras analizadas con HBsAg y/o anticuerpos anti-HBc reactivos, se detectaron 21 casos positivos para las regiones S/P y/o preC-C de HBV. A partir del análisis filogenético, se observó la circulación de los subgenotipos A1, A2, D3, F1b, F3 y F4. Para HDV, fueron 40 los casos positivos de los cuales 8 fueron secuenciados, clasificando todos ellos dentro del genotipo 1. La prevalencia para anti-HDV fue 1,97% y para marcadores virales asociados se observó un 11,84% para anti-HCV y un 7,23% para HIV. DISCUSIÓN Se registró la circulación de diferentes genotipos de HBV y HDV previamente descripto en nuestro país. Los datos de prevalencia de HCV, HDV y HIV en individuos con marcadores serológicos de HBV demuestran la importancia de realizar el monitoreo de estos virus en esta población