El mosquito Aedes aegypti es el principal vector de los virus que causan las enfermedades como el dengue (Flaviviridae; Flavivirus; DENV-1, DENV-2, DENV-3, DENV-4), el chikungunya (Togaviridade; Alphavirus, CHIKV) y la fiebre por zika (Flaviviridae; Flavivirus, ZIKV) en el hombre. La amplia distribución de este vector en el territorio argentino, hace necesario el desarrollo y optimización de estrategias de control. Estudios de la variabilidad genética de este vector pueden contribuir en el diseño de estrategias de control costo-efectivas. Entre los genes mitocondriales, el gen de la nicotinamida adenín dinucleótido subunidad 4 (ND4) ha demostrado ser un excelente marcador para el análisis de la estructura genética de la población y eventos de colonización de Aedes aegypti. Por ello se propone un estudio de estandarización de las condiciones óptimas de la técnica ND4 para la determinación de la variabilidad y diferenciación genética de Ae. aegypti para la evaluación de la composición genética y la diferenciación de poblaciones de Ae. aegypti a nivel de micro-escala en la ciudad de Puerto Iguazú, con el objetivo de identificar potenciales poblaciones fuente de Ae. aegypti, como así también determinar si son poblaciones alopátricas o presentan polimorfismo genético, permitiéndonos establecer líneas de base para evaluar impacto post-intervenciones y para comprender el flujo de mosquitos entre fronteras, y de esta manera contribuir a la toma de decisiones sobre control vectorial basadas en evidencia, incluyendo introducción de mosquitos modificados o refractarios a la infección