En las últimas décadas, las anomalías congénitas (AC) han aumentado su importanciacomo causa de mortalidad infantil, lo que se contrapone al descensode las causas nutricionales e infecciosas.ObjetivosDescribir la frecuencia de AC mayores en recién nacidos, obtenida a través delRegistro Nacional de Anomalías Congénitas (RENAC), y comparar las frecuenciasentre los hospitales participantes y con las reportadas por otros registros.MétodosLa fuente de datos correspondió a los casos reportados por el RENAC entre noviembrede 2009 y septiembre de 2011. Se analizaron diferencias entre hospitalesy su asociación con posibles variables explicativas mediante regresión dePoisson. Las diferencias entre el RENAC y otros registros se analizaron mediantescores Z.ResultadosEl tiempo del hospital en el registro, la presencia del Estudio Colaborativo Latinoamericanode Malformaciones Congénitas (ECLAMC) en el establecimiento,el número de nacimientos y la presencia de servicio de genética en el nosocomiose asociaron positivamente con una mayor prevalencia. Para algunas ACespecíficas, se observaron diferencias significativas entre el RENAC y otros registros.ConclusionesLas diferencias entre hospitales se interpretan como un efecto de la derivaciónprenatal y de una mayor especialización en el registro. Las diferencias con otrosregistros pueden atribuirse tanto a cuestiones operativas como a divergenciasreales de prevalencia.